우선, 테스트하신 앱은 하이브리드앱 방식으로 웹페이지를 앱에서 띄우신 걸로 보이구요.
웹에서는 JS SDK Kakao.Auth.authorize 함수를 사용하셨습니다.
모바일 기기에서 Kakao.Auth.authorize 함수를 사용하면 카카오톡 앱으로 간편 로그인을 진행하는데요.
이경우 카카오톡 인텐트 스킴(intent:#Intent;action=com.kakao.talk.intent.action.CAPRI_LOGGED_IN_ACTIVITY;)을 호출하게됩니다.
제작하신 하이브리드앱의 shouldOverrideUrlLoading 구문에서 intent 스킴 호출 시, 분기 처리하는 부분이 있을 것으로 추측됩니다.