안녕하세요.
JS SDK authorize 방식으로 구현하셨군요.
(1) authorize함수 호출 시, 카카오에 인가요청하고 설정하신 리다이렉트URI로 이동하게됩니다.
(2) 리다이렉트URI로 인가코드(code파라메터)를 전달합니다. 페이지가 이동(302리다이렉트)되므로 기존 스크립트 객체는 모두 초기화됩니다.
(3) code파라메터를 가지고 토큰 받기API를 호출해야합니다. (쿠키에서 토큰을 얻을 수 없습니다.)
아래 예제 참고하시면 도움이 될 것 같습니다.