안녕하세요
변경 전 후로 AndroidManifest.xml에 등록하신 activity의 android:name이 다르기 때문에 에러가 발생한 것으로 보입니다.
kakao_flutter_sdk에서는 내부적으로 com.kakao.sdk.flutter.AuthCodeCustomTabsActivity를 사용하고 있고, 변경 전에 등록하신 com.kakao.sdk.auth.AuthCodeHandlerActivity는 안드로이드용 Kakao SDK에서 사용하고 있는 Activity입니다.